네덜란드 동인도회사 쿤의 함대가 반다제도를 침략할 때 네덜란드 군인들만 동원한 것은 아니었다. 가장 위험한 역할인 선발대에는 용병을 활용했다. 이들은 당시 동남아시아 바다에서 활동하던 왜구 집단이었다.

쿤은 주인없는 사무라이, 즉 일본인 낭인 80명을 선발대로 삼아 반다제도를 공격했다. 일본인 용병은 유럽인 병사보다 저렴하고 강인할 뿐 아니라, 참수와 검술에 통달한 고도로 숙련된 전문 검객들이었다.

가일스 밀턴의 <향료 전쟁(원제: 나다니엘의 육두구)>이라는 책에는 당시 동남아시아 바다에서 용병으로 활동한 왜구들의 모습이 생생하게 그려져 있다.

“일본 배에서 영국 배로 넘어오는 일본인들의 숫자가 점점 늘어나고 있었으나 에드워드와 다른 선원들은 전혀 눈치 채지 못했다. 동서양의 해적들이 이렇게 화기애애한 가운데 갑자기 칼을 빼든 일본 해적 두목이 곁의 영국인을 후려치는 것을 신호로 일본 해적들은 미친 개처럼 주변의 영국인들을 마구 베기 시작했다. 선상은 삽시간에 도살장처럼 변했다. 일본인들은 기합을 지르며 되는대로 베고 찔렀다.(중략) 기세가 오른 일본인들은 전신에 피를 뒤집어쓴 귀신같은 꼴로 다른 목표를 찾아 선교로 몰려왔다. 영국인들은 다 죽임을 당하고 배의 탈취는 시간 문제인 듯 했다.”

왜구들은 네덜란드의 용병으로만 활동하지는 않았다. 그전에는 포르투갈의 용병으로 활동했고 영국의 용병으로 활동하기도 했다. 돈만 받으면 누굴 위해서도 일할 수 있는 진정한 용병들이었다.

네덜란드가 암보이나 대학살을 저지른 2년 뒤인 1623년, 암보이나 대학살에 가담했던 일본 낭인들이 이번에는 네덜란드군을 공격하고 암보이나를 점령하려는 영국의 음모에 가담했다 적발되는 사건이 일어나기도 했다. 쿤은 일본인 낭인 9명을 참수했다. 물론 영국 동인도회사는 이 사건 자체가 네덜란드가 고문으로 조작한 사건이라고 주장했다.

왜구들은 단순히 용병으로만 활동하지는 않았다. 당시 동남아시아의 바다에서 펼쳐지던 열강들의 무역전쟁의 중요한 구성원으로서의 역할도 했다. 당시 해금정책을 펼치던 중국은 물론 일본과의 무역 네트워크를 잇는 역할을 바로 왜구가 맡았다. 당시 일본의 도쿠가와 막부는 공식적으로는 쇄국정책을 펼쳤지만 지역의 다이묘들은 왜구들의 존재를 인정하고 이들을 적극 활용했다.

일본이 미국에 의해 강제 개항한 이후 빠르게 근대화에 성공할 수 있었던 배경에는 왜구를 통해 동아시아의 국제 무역망에 계속 연결돼 있었던 점도 크게 작용했다.