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교토단풍여행 5일차 - 산토리맥주공장, 후시미이나리
[시리즈] 2411_교토단풍여행 · 교토단풍여행 1일차 - 니시키시장 · 교토단풍여행 2일차 - 아라시야마 · 교토단풍여행 3일차 - 철학의길, 야마시나, 가와라마치 · 교토단풍여행 4일차 - 나라 사슴공원, 교토타워, 기요미즈데라 6일차는 출국일이니 어찌 보면 정식 여행 일정 마지막날야마자키 증류소 추첨은 개같이 실패했기에, 오전에 산토리 맥주 공장 투어만 예약해둔 상태라 별 일정이 없었음일단 맥주부터 마시자는 마인드로 하루를 시작했다5일차 일정산토리 맥주 공장이 외곽이라 동선이 살짝 길어지긴 했는데차피 열차타고 다니니 편했다산토리 공장 투어가 열시라서 좀 일찍 출발함외곽으로 나가니 뭔가 여행?가는 느낌니시야마텐노잔역 도착앞에 진짜 아무 것도 없는 주택가다그리고 멀리 보이는 오늘의 목적지실제로 가는데 걸어서 십분 정도면 충분했음열차에서 알아본 아침먹을 곳西山こっぺ堂 本店 이라는 빵집이다로컬에서 사랑받는 듯한 리뷰가 많기도 했고, 이 근방에 여기밖에 없었음선택은 국룰 야키소바빵이랑 든게스결론만 말하면 야키소바빵이 진짜 맛있었음산토리 투어오면 꼭 드셈바로 앞 패밀리마트서 음료사들고 공원에 앉아서 먹었다그리고 산토리 공장 입성투어용 건물이 따로 있는데 안내원들이 친절히 알려준다딥따 큰 탱크대기업의 상업양조는 역시 스케일이...라거탱크도 존나 많다이쪽으로 오니 서늘해짐그리고 이 곳의 투어는 마지막에 물류까지 보여주는데이게 되게 신기했음그리고 하이라이트인 시음첫 잔인 산토리 프리미엄 몰츠태어나서 먹은 라거 중에서도 손꼽히는 맛이었다또 먹고싶네 진짜그리고 테이스팅으로 주는 프리미엄몰츠, 카오루에일, 마스터즈드림막잔은 하나 선택해서 풀잔으로 먹을 수 있음솔직히 산프몰 마시려다가 먹을 기회가 적은 마스터즈 드림 마심 시음시간이 30분 정도로 짧으니 빠르게 마셔야 한다여튼 별 기대 안 하고 간 투어였는데, 여태 갔던 맥주 공장 투어 중에서 가장 만족도가 높았음인원도 적고 가이드분도 되게 친절하고 스몰토크도 많이 했음여튼 다음에 교토가면 또 가지 않을까 싶다끝나니 점심에 조금 못 미치는 시간이라 후시미이나리 신사 가기로 결정그 앞에서 라멘이나 먹자고 하고 JR타러감다시 한큐선 타고 오야마자키로 간 다음, 내려서 JR야마자키역으로 환?승 했다걸어서 5분?정도 걸린듯역이 이뻐서 한 컷 찍음후시미이나리 내리니까 바로 앞에 대빵큰 도리이가 있었다목적지인 라멘집은 이거 지나서 다리 건너야 함근데 여긴 또 가을 느낌이 느껴지는 듯날씨+천변풍경이 이뻤다Kyoto Shoryu 라는 라멘집인데 관광객들이 끊임없이 회전되는 곳이었음교자랑 덮밥까지 있는 정식 세트로해서 1000엔 정도이니 가성비가 좋았다근데 교자는 애매했음그래도 맥주 마시고 공복이니 싹싹비움나와서 소프트 하나씩 조져줌다시 다리 건너다 반대편 한컷본격적으로 후시미이나리 신사 구경 시작함교토 세번째인데 후시미이나리는 처음이라 기대를 품고 들어갔다이때가 오후 2시쯤그리고 또 뽑은 오미쿠지기요미즈데라의 흉을 덮어쓸 생각으로 뽑았는데 존내 애매하다뽑고 앞에서 한국말로 중얼대니 무녀로 보이는 알바분이 한국어로 해설해줌한국말 공부했다는데 나보다 잘하는거같기도 하고...근데 죄다 안 좋은 말이니 서로 머쓱해졌다ㅋㅋㅋ묶어놓고 센본도리이 입갤함아래쪽에는 사람 많아서 사진 찍기 어려웠는데위로 올라갈 수록 사람이 적어져서 늦게 와도 크게 붐비지 않았다중간중간 다른 소재로 된 도리이도 있어서 계속 쳐다보면서 갔다그리고 본격적인 산길 입구의 사당연못 옆에 붙어있는데 무슨 보스전 할 듯한 분위기여서 장난아녔음그리고 헐떡대면서 요쓰쓰지? 까지 올라옴올라 올수록 체력 좋은 서양인 비율이 높아졌음ㅋㅋ확실히 올라오니 전망이 트여서 멋있다구름 한 점 없는 날씨도 한 몫을 해줬는데 홀린 듯이 사진 찍음내려가는 길에 뒤에 누가 언제 봉납했는지 써둔거 읽었음생각보다 법인에서 한 것들이 많아서 놀랐음이거 보는 것도 재밌더라이후 요즘 엠제트 핫플인 신푸칸 갔음빔즈랑 메종키츠네 구경 하다가 스텀프커피에서 한잔 조져줌카페인 흡수하다보니 갑자기 어두워져서 알아뒀던 술집 가는 길지나가다 만화박물관에 불새가 보여서 찍음그저 "만신"근데 전 술먹으러 갈거애요마루타마치역이 더 가까운 TAKANOYA 라는 술집임마치야를 보존해서 그대로 술집으로 운영하는 곳인데실제로 내외부는 전형적인 일본식 가옥이라 멋있었음크래프트 비루 일체누드비어 먹어봤는데 가격값은 못 하는 느낌...근데 여기 음식들이 예사롭지 않다시키면 오래 걸리긴 하는데 바로 앞에서 요리하는걸 보는 것 만으로도 재밌음굽기도 장난 아님20분 걸려서 나왔는데 5분컷하이라이트였던 청어구이진짜 존나 맛있었음보니까 서양인들이 많이 오던데일식에 크래프트맥주 페이링이니 궁금해서 많이 오는듯그리고 계속 궁금했던 호텔 바로 앞의 Casa di Ciro 라는 핏제리아 와봄마지막 저녁이다 보니 위장에 무리를 줘서라도 다 먹겠다는 의지로 갔다결과적으로 아주 성공적이었음신선한 바질, 올리브오일의 향이 좋았고 도우도 바삭하니 참 맛있었음일본오면 항상 이탈리안을 먹게 되는거 같은데 저점이 높은 느낌이라 부러움그리고 숙소에서의 마지막 목욕탕 즐기고 커푸멘 조져줌잦이푸딩은 편의점에 없어서 못먹었고 대신 크림브륄레 머시기 먹음정리할 겸해서 숙소에서 마신 캔맥들아무래도 외부 일정이 많아서 숙소에선 많이 먹진 않았다나름 알차게 즐긴 5일차 끝
작성자 : 범한_pantos고정닉
싱글벙글 PCR 검사의 원리
[시리즈] 싱글벙글 생명공학 · 씨발씨발 유전자 편집 아기의 진실 · 유전자를 바꾸었지만 GMO는 아닌 식물이 있다??? 코로나 시절 다들 PCR검사를 위해 콧구멍을 뚫려 본 경험이 있을 거임근데 PCR이 과연 뭐길래 코로나 검사에 쓴다는 걸까?1. PCR이란?PCR은 Polymerase Chain Reaction의 약자로 '중합효소 연쇄 반응'이라는 의미임여기서 중합효소는 DNA 중합효소를 의미하는데, DNA 합성을 하는 효소라는 뜻즉 DNA 중합효소를 연쇄적으로 반응시킨다는 것으로, DNA의 수를 늘리는 반응임이게 왜 필요하냐면, 모든 생명체와 바이러스(바이러스는 보통 생물이라 보지 않음)는 핵산(RNA, DNA)을 가지고 있음핵산은 생명체의 설계도 역할을 하기 때문에 분석하면 유용한 정보를 얻을 수 있음, 어떤 종인지, 친자관계인지, 유전병이 있는지 등등감염병 진단에서도 몸에서 바이러스의 핵산이 나왔다면 감염됐다고 볼 수 있고 이게 가장 정확한 방법임.하지만 핵산은 양이 적기 때문에 바로 분석하기는 어려워 증폭하는 단계가 필요하고 이게 PCR이다.PCR이 없던 시절에는 DNA를 분석하려면 많은 양의 시료에서 DNA만 추출해야 했음, 요즘 검사처럼 면봉에 묻은 정도로는 턱도 없다.2. PCR의 과정DNA가 복제되는 방식을 간단하게 나타나면 그림과 같음이중나선 형태로 꼬여있는 DNA가 두 가닥으로 풀어지고, 각 가닥에서 상보적인 염기쌍의 DNA가 합성되면서 두배가 되는 거임그래서 복제를 하려면 일단 각각의 가닥으로 풀어줘야 하고 이를 Denaturation이라 함.방법은 간단한데 그냥 95도 정도로 가열하면 알아서 분리된다.그 다음으로는 프라이머(Primer)라는 걸 붙여줘야 함, 프라이머는 DNA 중합효소가 합성을 시작하기 위해 필요한 작은 핵산 조각임.RNA나 DNA 모두 가능한데 PCR에서는 DNA를 씀 RNA는 쉽게 분해되고 DNA로 바꾸는 과정이 추가적으로 필요해서 DNA를 씀.이 프라이머를 어떻게 넣는지에 따라 증폭되는 DNA 부위가 결정됨. 프라이머를 코로나 바이러스만 가지고 있는 서열로 만들면 코로나 바이러스의 DNA만 증폭이 되는거임 (사실 코로나 바이러스는 DNA가 아니라 RNA만 가지고 있음, 어떻게 하는지는 후술함)DNA합성은 방향성이 있어서 앞뒤로 프라이머를 붙여주면 그 사이의 DNA 조각을 얻을 수 있음이 프라이머를 붙여주는 작업은 Annealing이라고 함, 온도는 50~65도인데 온도는 프라이머의 염기서열에 따라 달라짐(서열 따라 결합 강도가 다르기 때문)옛날에는 프라이머를 만드는 게 굉장히 어려웠지만 이제는 생화학의 발달로 업체에 인터넷으로 주문하면 하루만에 택배로 보내주고 가격도 별로 안비쌈보통 17~30 Mer(염기 개수) 정도 길이로 만들고 앞뒤로 한쌍이 필요하니 2만원이면 DNA증폭에 필요한 프라이머를 살 수 있음. 필요한 만큼 사서 쓰면 된다.다음은 Elongation, DNA중합효소가 작동하게 기다리는 과정임. Denature 단계에서 97도까지 올라가는 온도를 견딜 수 있도록 뜨거운 온천에서 사는 세균의 효소를 사용하는데 이 효소가 가장 효과적으로 작동하는 온도는 72도라서 그 온도에 맞춤.옛날에는 이 과정이 제일 문제였음 온도를 한번 올리고 나면 효소가 다 익어버려서 한 사이클 돌아갈 때 마다 새로 넣어야 했는데 호열균(뜨거운 환경에서 사는 세균)의 효소를 사용하는 아이디어를 내서 훨씬 빠르고 간편해졌고 이걸 고안한 사람은 노벨상 받음(Kary Mullis)이렇게 Denaturation, Annealing, Elongation을 한번씩 거치면 한 사이클이 끝나고, 이걸 n번 반복하면 2의 n승 만큼 DNA 조각이 늘어남보면 알겠지만 효소와 프라이머가 필요한 것 빼고는 그냥 온도를 조절해줬을 뿐임, 그래서 PCR장비를 Thermocycler라고도 하고 다른 기능이 붙어있지 않은 장비는 그렇게 비싸지도 않음(작은 건 백만원대도 있음)물론 이런 건 고등학교 정도에서나 쓸 법한 거고 생물학 랩에서 쓰는 건 천만원 넘어감초창기에는 PCR Bath라 해서 이런 수조 3개에 온도 각각 설정해 놓고 시험관 옮겨 가면서 실험했다고 함;;3. PCR 진단PCR로 바이러스의 DNA조각이 나오면 감염된거라고 볼 수 있다고 했음.하지만 코로나바이러스는 RNA를 유전물질로 가지기 때문에 DNA중합효소로 합성할 수 없음, DNA중합효소는 DNA만을 주형으로 삼기 때문.그래서 우선 RNA를 DNA로 바꿔줘야 하고 이걸 하는 효소가 역전사효소임(Reverse Transcriptase), 원래는 레트로바이러스가 자신의 RNA를 DNA로 만들고 숙주의 유전자에 삽입하기 위해서 쓰는 효소.역전사를 해서 DNA로 만든 뒤에는 동일하게 PCR하면 됨, 이걸 RT(Reverse Transcriptase)-PCR라 함.이때 프라이머에 형광물질을 붙여 두면 형광이 얼마나 나오는지로 코로나바이러스 DNA조각이 증폭되었는지, 그 양이 얼마나 많은지를 알 수 있는데 이걸 q(Quantitative)PCR이라 하고 코로나의 경우 RT-PCR이기도 하니 RT-qPCR임최종적으로는 증폭된 DNA가 포함된 용액에서 나오는 형광을 보고 감염 여부를 판단하는 것.물론 형광표지가 붙은 프라이머는 훨씬 비싸고 실시간으로 형광 측정하는 기능이 있는 PCR 장비도 비쌈.4. 폴링검사PCR검사는 사실 감염이 의심되거나 주변에 감염자가 생겼을 때 받는 건데 그렇다 해도 대부분 비감염자가 더 많음이런 상황에는 한명한명 다 따로 하고 있는건 비효율적임시료를 반으로 나누고, 5명씩 묶어서 PCR을 돌리고 음성이 나오면 5명 전부 음성, 양성이면 5명 각각 한명씩 PCR을 돌리는 게 훨씬 빠름. 이걸 폴링검사, 영어로는 Pooled test라 함.몇명을 묶을지는 감염자가 얼마나 나오냐에 따라 다름, 거의 안나온다면 더 많이 묶어도 되지만 거의 전부 나온다면 어차피 따로 한명씩 또 돌려야 하니 검사 횟수가 늘어날 뿐임. 5. 최신동향PCR의 등장은 생물학과 생명공학에 큰 도움이 됐음, 머리카락으로 친자검사가 가능한거나 범죄현장의 혈흔으로 DNA를 분석하는 것, 구강상피세포로 유전자 검사를 할 수 있는 것 모두 PCR로 DNA를 증폭했기 때문에 가능한 일임.이러한 PCR 기술은 발전을 거듭하고 있고 가격도 점점 낮아지고 있는데 만약 코로나가 2000년대 초반에 일어났다면 그렇게 신속하게 감염 여부를 판단하고 격리하지 못했을 거임, 그때도 PCR은 있었지만 프라이머도 비싸고 장비도 고가에 느렸거든.최근에는 아에 마이크로 칩 하나로 PCR을 구현하는 연구도 진행되고 있음이상 PCR의 원리였습니다.
작성자 : 킹크림슨발록고정닉
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