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작성자 : ㅇㅇ고정닉
현재 모든 생명체의 직접적인 조상: LUCA
계통수란 생명체의 진화적 유연관계를 나무의 형태로 요약하여 보여주는 그림이다 초등학교 수준에서는 동식물 정도만 구분하나, 교육과정이 올라가며 박테리아와 고균 진핵생물의 3역 6계 체계를 배우게 된다 계통수 상으로 가지가 늦게 갈라져 나올수록 유전적으로 가깝다는 의미이고, 뿌리에 가까울수록 일찍 갈라져 근연관계가 멀다는 것을 쉽게 알아볼 수 있다 그렇다면 이 나무의 가장 깊은 곳에는 무엇이 존재할까? 계통수의 뿌리에 위치하는 종을 LUCA(Last Universal Common Ancestor), 모든 현존 생물의 공통 조상이라고 부른다 최초의 생명체(FUKA)와는 다른 개념으로, LUCA 이전에도 동시대에도 다른 생명체들이 많이 존재했으나 그들의 후손들은 멸종하고 현재 LUCA의 후손들만이 남았다는 것이다 LUCA의 개념 자체는 다윈이 종의 기원에서 서술했을 정도로 오래되었다 다만 추론의 영역이었던 과거와는 다르게 현대에는 분자생물학과 지질학의 발달로 인해 체계적으로 재구성할 수 있게 되었다 LUCA의 흔적을 더듬어 나가는 것에는 미생물 화석 연대측정, 생명체들의 공통 유전자, 공통 물질대사, 암석의 유기물질 비율 분석 등 다양한 방법이 사용된다 이와 관련해 UCL 연구팀이 연구한 성과가 7월달 네이처지에 실렸는데 여러 흥미로운 주장이 나온다 미생물 화석 및 유전자 분기 시간 추정을 통해 분석한 결과 LUCA는 약 42억 년 전부터 존재했었다는 것으로 추정된다 이는 달이 생성된 지 불과 1-2억년 뒤이며 기존 최초의 생명체 추정연대의 상한선인 38억년 전을 월등히 상회한다 약 41억 년부터 38억 년 전 까지 수 억 년에 걸쳐 전 지구적인 소행성 대충돌이 일어났고 이를 후기 대폭격Late Heavy Bombardment이라고 부른다 이전에는 생명체가 저런 환경에서 탄생하거나 살아남을 수 없을 것이라 생각했으나, 지각이 녹아내리는 와중에도 바다 가장 깊은 곳에 있던 초기 생명체들이 살아남아 진화할 수 있었다는 것이다 생태적인 부분에서도 많은 발견이 이루어졌다 연구팀은 고균 350종과 박테리아 350종의 유전자를 분석하여 공통 유전자를 추려 내고, 외래 유전자를 최대한 배제하는 방식으로 LUCA의 유전자를 추측했다 그 결과 2657개의 유전자가 식별되었으며 이로 인해 생활사를 유추할 수 있었다 LUCA는 혐기성 원핵생물로, 이산화탄소와 수소를 이용해 대사 산물로 아세트산을 생성했다고 추정된다 또한 초고온성 미생물의 효소를 가졌을 확률이 높으며 광합성을 하지 않았다고 예상된다 이로서 최초의 생명체가 유기물로 가득찬 바다 표면에서 탄생했다는 '원시 수프 가설'은 타격을 입고 빛이 없는 열수구에서 탄생했다는 '심해 열수구 가설'이 더욱 힘을 받게 되었다 공통 유전자로 유추한 LUCA의 유전자 중 바이러스 면역을 담당하는 부분도 존재하는데, 그로 인해 이미 그 당시부터 바이러스가 LUCA를 공격했다는 사실도 알 수 있다 LUCA가 특정한 종을 의미하는 단어처럼 보일 수 있으나 사실 엄밀하게는 개념적인 존재에 더 가깝다 과거의 계통수에선 진핵생물의 조상이 LUCA라고 여겨졌으나, 박테리아가 세분화되고 고균이 추가되는 등 분자생물학이 발달하자 LUCA는 점점 더 깊은 과거로 밀어넣어지고 있다 최근에도 2013년 새로운 고균 문인 DPANN과 2018년 박테리아의 새로운 문인 CPR이 발견되어 LUCA의 새로운 유전적 조건을 추가하게 되었다 한편 수평적 유전자 이동Horizontal Gene Transfer의 존재로 인해 LUCA를 재구성하는 연구방식에 회의적인 의견도 존재한다 고등학교 시절 배운 그리피스의 형질전환 실험에서 알 수 있듯이, 생명체의 유전물질은 부모-자손간의 수직적 방향으로만 전달되는 것이 아니라 다른 유전자를 받아들이는 수평적 전이도 이루어진다 인간만 해도 전체 유전자의 8% 가량이 바이러스에서 전이되었다는 연구결과가 존재한다 LUCA 전후로 멸종한 생명체(회색)들 역시 이미 LUCA와 그 후손들(검은색)에게 유전자 전이(빨간색)를 통해 자신의 흔적을 남겼을 확률이 높다 이렇게 여러 종 간의 유전자가 섞인 상황에서 단순히 수직적인 계통만을 반영해 LUCA를 재구성하는 것은 정확하지 않다는 것이다 그럼에도 가장 기초에 가까운 생명체의 형태를 알 수 있는 연구라는 점에서 외계생명체의 조건과 연관되기에 LUCA의 재구성은 생물학계뿐 아니라 NASA에서도 관심을 가지고 지켜보는 주제이다 Moody, E. R. R., Álvarez-Carretero, S., Mahendrarajah, T. A., Clark, J. W., Betts, H. C., Dombrowski, N., Szánthó, L. L., Boyle, R. A., Daines, S., Chen, X., Lane, N., Yang, Z., Shields, G. A., Szöllősi, G. J., Spang, A., Pisani, D., Williams, T. A., Lenton, T. M., & Donoghue, P. C. J. (2024). The nature of the last universal common ancestor and its impact on the early Earth system. Nature ecology & evolution, 8(9), 1654–1666. Moody, E. R. R., Mahendrarajah, T. A., Dombrowski, N., Clark, J. W., Petitjean, C., Offre, P., Szöllősi, G. J., Spang, A., & Williams, T. A. (2022). An estimate of the deepest branches of the tree of life from ancient vertically evolving genes. eLife, 11, e66695. Aylward, F. O., & Moniruzzaman, M. (2022). Viral Complexity. Biomolecules, 12(8), 1061.
작성자 : ㅇㅇ고정닉
개발자가 말하는 CRT 도트에 대한 오해
Kingmakers을 개발 중이고 Road Redemption 개발한 개발자가2달 전쯤에 픽셀아트(도트)에 대한 트윗을 올렸음스레드가 좀 많이 긴데 일단 스레드의 첫 글부터 읽어보자https://x.com/BATTLE_ATHLETE/status/1817965316145647974/video/1위에서 언급하고 있는 '영상'이라는 건 위 링크에서 나오는 어떤 틱톡 영상을 말함그 영상에서 털보 아저씨가 하는 말을 요약하자면옛날 픽셀 아티스트들은 CRT 출력을 생각하고 왼쪽을 의도해 오른쪽 도트를 찍은 건데현대 픽셀 아티스트들은 왼쪽같은 부드러운 이미지가 아니라 오른쪽 도트를 그대로 따라하는 실수를 하고 있다는 거임삽질기사에 있는 검정 외곽선 그거 레트로다운 도트 아니야삽질기사 같은 대비가 강한 색상 선택? 레트로다운 도트 아니야지금은 CRT가 아니니까 부드럽게 도트 찍어야지라는 것...다시 스레드로 돌아가자면너가 예시로 든 피치 공주 그거 픽셀 아티스트들이 찍은 도트 아님 ㅋㅋ3D 폴리곤을 도트로 변환해서 가공한 거야~구글 번역 교정: 복합 TV 신호 >> 컴포지트 TV 신호물론 흐린 CRT 화면을 고려해서 도트를 찍은 사람들이 있기는 했다하지만 그런 사람들이 주류는 아니라는 것구글 번역 교정: 복합 신호 >> 컴포지트 신호https://gall.dcinside.com/mgallery/board/view/?id=aoegame&no=22432581컴포지트와 RGB 차이는 위 링크에서 좀 더 자세히 볼 수 있음RF < 컴포지트 < 컴포넌트 < RGB우측으로 갈수록 선명하다아무튼 당시의 프리미엄 플랫폼은 아케이드 게임기였다그때의 픽셀 아티스트들은 자신의 도트가 더 좋은 기기에서 어떻게 보일지 신경썼던 것요즘으로 치자면 GTA 6를 개발하는데 저사양 PC가 아닌고사양 PC에서 게임이 어떻지를 생각하면서 개발하는 것과 같다RGB로 연결했어도 당시의 TV들은 이 얼룩덜룩한 스캔라인을 피해갈 수 없었는데하지만 픽셀 아티스트들은 아케이드보다 더 좋은 화면에서 작업했음어떻게?IBM식 컴퓨터가 세계 곳곳에서 만들어지는 와중에도80년대 일본은 독자적인 아키텍쳐의 PC를 만들어썼다한자를 읽기에 IBM식 컴퓨터들은 스캔라인으로 가독성이 나빴기 때문그 컴퓨터가 바로 갈라파고스화 예시로 항상 나오는 PC-98이다해상도도 640x400로 엄청 짱짱하다'창작자의 의도'를 찬양하는 너네들이 언급한 픽셀 아티스트들은 다 어느 나라 사람?일본 사람~그 사람들은 선명한 화면에서 도트 찍었어증거 있냐고?디지털 방송이 도입되기 전에 TV를 봤던 딸피들은 기억할 것이다옛날 TV는 전부 4:3이었다는 걸8:7 비율의 게임을 4:3인 TV에 연결하면 좌우로 펑퍼짐하게 나온다픽셀 아티스트들이 가정용 TV에서 도트가 어떻게 보일지 생각했다면이렇게 많은 타원형 도트들이 게임에서 보일리가 없을 것임국내 여러 커뮤니티에서도 많이 돌아다닌 짤악마성의 드라큘라 도트는 컴포지트 CRT 화면에서단순한 빨간점이 눈 전체로 멋들어지게 퍼지는 걸 볼 수 있다과연 이건 픽셀 아티스트가 의도한 것일까?원화/요즘 화면/CRT에 컴포지트 연결8:7과 4:3의 이야기를 떠올려보면서원화와 도트를 비교해보면 보이는 것이 있을 것이다그렇다 오른쪽 도트는 다른 두 짤보다 좌우로 펑퍼짐한 것이다드라큘라의 눈에 대한 부분도 다른 원화를 보면 명확하다드라큘라의 눈은 눈동자만 빨갛지눈 전체가 빨갛지가 않다심지어 후기 작품에 나올 때조차 눈 전체가 빨갛게 된 적은 없다즉, 악마성조차 픽셀 아티스트가 자기 컴 화면만 보면서 도트를 찍은 것이다
작성자 : 빗소리P고정닉
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