일본프로야구 신인 드래프트 방식은 정말 독특한데, 전세계 어떤 종목에서도 보기힘든 방식인 1라운드 지명권 추첨제가 바로 그것이다. 한국프로야구의 경우에는 1라운드는 지역별 우선지명권이 존재하며, 메이저리그는 전시즌 성적 역순으로 지명하는데 일본 프로야구는 그런거 없이 추첨운 하나에 드래프트 지명의 승패가 갈린다.

12개 프로구단은 신인드래프트에 참가한 모든 참가자중, 지역, 전시즌 성적 그딴거 무시하고 아무나 1명을 선택하게 된다. 이때 지명팀이 점찍은 선수에 다른 팀이 지명하지 않았을 경우에는 해당 구단이 단독 지명권을 가지게 되며, 2팀 이상이 1명의 선수를 지목했다면 이때부터 운에 맡기는 추첨식을 시작한다. 지명한 팀들끼리 나와서 제비뽑기를 하며, 이중 당첨된 구단이 해당 선수에 대한 지명권을 가지게 된다. 이후 추첨에서 탈락한 구단들은 다른 선수를 지명할 수가 있는데 이때 또다시 2팀이상 지명한 선수가 등장하면 또다시 지명한 팀들끼리 조추첨을 하게 된다. 이런 시스템 덕분에 매년 신인드래프트는 상당히 관심을 불러일으키게 된다. 특히 여러구단이 노릴만한 특출난 신인이 나오는 해는 그 선수의 운명이 어떻게 결정될지에 관심을 가지는 팬들이 많고 최고의 신인을 우승팀이라고 무조건 하위팀에게 양보하는 것이 아니라 운만 좋으면 노려볼 수 있는 강렬한 도박성과 내심 원하던 팀이 아닌 엉뚱한 팀이 교섭권을 가져가는 경우 뭐라 표현하기 힘든 오묘한 표정을 짓는 선수의 모습, 그리고 그 선수가 자신의 진로에 대해 어떻게 결정을 내릴지 등등 화제성이 풍부하기 때문에 시청률이 본업인 야구경기보다 더 많이 나오는 경우도 있다.